Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CAB39Q9Y376 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms