Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR3KQ9Y2Y1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3KQ9Y2Y1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms