Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED16Q9Y2X0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED16Q9Y2X0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED16Q9Y2X0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED16Q9Y2X0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED16Q9Y2X0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED16Q9Y2X0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED16Q9Y2X0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED16Q9Y2X0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms