Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms