Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITM2BQ9Y287 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITM2BQ9Y287 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms