Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAF3IP3Q9Y228 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms