Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMC3Q9UQE7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMC3Q9UQE7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms