Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG5Q9UPR3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms