Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML1Q9UN30 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML1Q9UN30 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms