Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULR3

PPM1H, Protein phosphatase 1H, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1HQ9ULR3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1HQ9ULR3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1HQ9ULR3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms