Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT6Q9ULM6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms