Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED23Q9ULK4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MED23Q9ULK4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms