Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PALD1Q9ULE6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PALD1Q9ULE6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms