Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND2AQ9ULE3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND2AQ9ULE3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms