Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HDAC9Q9UKV0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms