Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN4Q9UJW0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCTN4Q9UJW0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms