Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBE1Q9UJT0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBE1Q9UJT0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBE1Q9UJT0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms