Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD1Q9UIS9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms