Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms