Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN2A-AS1Q9UH64 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms