Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA6Q9UF33 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA6Q9UF33 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms