Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJB4Q9UDY4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJB4Q9UDY4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJB4Q9UDY4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJB4Q9UDY4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJB4Q9UDY4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJB4Q9UDY4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms