Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG4Q9UBN1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms