Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms