Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTTNBP2NLQ9P2B4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms