Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTGFRNQ9P2B2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms