Protein–RNA interactions for Protein: Q9P283

SEMA5B, Semaphorin-5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5BQ9P283 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA5BQ9P283 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA5BQ9P283 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms