Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms