Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L1Q9P0L9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms