Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf109Q9NX04 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf109Q9NX04 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms