Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLN6Q9NWW5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLN6Q9NWW5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms