Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM28Q9NW13 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms