Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX18Q9NVP1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
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