Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRT84Q9NSB2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms