Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LTBP3Q9NS15 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP3Q9NS15 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTBP3Q9NS15 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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