Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB3Q9NQW8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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