Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
INCENPQ9NQS7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
INCENPQ9NQS7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms