Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB9BQ9NP90 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB9BQ9NP90 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms