Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD33

MRPL47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL47Q9HD33 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL47Q9HD33 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL47Q9HD33 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL47Q9HD33 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL47Q9HD33 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL47Q9HD33 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL47Q9HD33 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL47Q9HD33 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL47Q9HD33 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL47Q9HD33 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL47Q9HD33 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL47Q9HD33 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms