Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDFQ9HBH1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDFQ9HBH1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms