Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC52A2Q9HAB3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC52A2Q9HAB3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms