Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NHEJ1Q9H9Q4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms