Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms