Protein–RNA interactions for Protein: Q9H867

VCPKMT, Protein-lysine methyltransferase METTL21D, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPKMTQ9H867 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPKMTQ9H867 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VCPKMTQ9H867 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPKMTQ9H867 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPKMTQ9H867 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPKMTQ9H867 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPKMTQ9H867 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPKMTQ9H867 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPKMTQ9H867 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPKMTQ9H867 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCPKMTQ9H867 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCPKMTQ9H867 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCPKMTQ9H867 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms