Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NRDE2Q9H7Z3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms