Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNCQ9H7C4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms