Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf42Q9H799 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf42Q9H799 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms