Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms