Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD1Q9H3U5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD1Q9H3U5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD1Q9H3U5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD1Q9H3U5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD1Q9H3U5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD1Q9H3U5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD1Q9H3U5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms