Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N1

TMX1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1Q9H3N1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMX1Q9H3N1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMX1Q9H3N1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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